航运是物资补给的重要方式之一，主要通过运输机实现跨区域快速投送。运输机能够运送多种关键物资，包括军需物资如弹药、食品和燃料，装备配件如改进型子弹和防护装甲，以及新兵和补给兵力。这种运输方式不受陆地地形限制，能够快速响应前线需求，尤其在紧急增援或远距离作战时具有不可替代的战略价值。运输机的使用需要提前建造空军基地并研发相应科技，同时需注意其非战斗属性，在运输过程中需安排战斗机护航以防敌方拦截。
物资航运的效率受多种因素影响，包括空军基地等级、运输机数量以及物流科技水平。游戏中的科技树设有专门的物流研发方向，投入科研点数可解锁更高效的运输技术，例如提升单次运输容量或缩短运输冷却时间。天气系统也会对航运造成实质性干扰，恶劣气候会降低飞行速度并增加事故风险，这要求玩家在规划航线时综合考虑气象预报和敌方防空力量分布。运输机无法运送重型装甲单位，这类物资仍需依赖铁路或公路运输体系。
首先需要在物资仓库界面选择待运输的资源类型和数量，然后指定目标城市或前线基地。系统会根据两地距离自动计算所需油料和时间，玩家可手动调整优先运输的物资类别。在多人合作模式下，联盟成员之间可以通过运输机实现物资互助，这种协作能显著提升整体资源利用效率。物资到达目的地后会自动进入该区域的仓储系统，若仓储空间不足则会造成资源损耗。
从战略层面看，航运补给线的维护与破坏是双方博弈的重点。玩家需要建立完善的防空网络保护己方运输航线，同时派遣侦察机定位敌方补给节点，通过战斗机或防空炮实施拦截。历史上重要的绞杀战战术在游戏中得到还原，切断敌方航运线路能有效削弱其持续作战能力。游戏后期开发的先进雷达技术可以扩大防空识别区，为运输机提供更安全的航道规划支持。
物资航运系统与游戏其他机制存在深度联动。首都与经济中心的物资生产水平决定了可调配资源总量，而仓储设施的等级直接影响航运调度的灵活性。在大型军团作战中，通常需要设立专职的后勤指挥官统筹运输机队运作，这与现实战争中后勤体系的组织方式高度吻合。游戏通过这种设计强调现代战争中后勤即战斗力的核心原则，要求玩家在发展军备的同时必须同步建设支援保障体系。
